Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOP08100 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOP08100 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOP08100 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOP08100 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOP08100 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOP08100 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOP08100 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOP08100 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOP08100 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOP08100 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOP08100 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOP08100 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOP08100 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOP08100 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOP08100 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOP08100 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOP08100 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOP08100 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOP08100 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOP08100 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOP08100 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOP08100 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOP08100 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOP08100 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOP08100 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOP08100 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOP08100 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOP08100 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOP08100 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOP08100 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOP08100 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOP08100 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOP08100 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOP08100 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOP08100 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOP08100 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOP08100 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOP08100 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOP08100 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOP08100 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOP08100 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOP08100 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOP08100 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOP08100 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOP08100 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOP08100 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOP08100 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOP08100 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOP08100 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOP08100 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOP08100 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOP08100 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOP08100 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOP08100 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOP08100 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOP08100 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOP08100 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOP08100 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOP08100 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOP08100 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOP08100 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOP08100 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOP08100 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOP08100 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOP08100 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOP08100 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOP08100 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOP08100 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOP08100 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOP08100 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOP08100 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOP08100 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOP08100 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOP08100 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOP08100 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOP08100 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOP08100 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RHOP08100 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RHOP08100 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RHOP08100 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOP08100 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOP08100 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOP08100 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOP08100 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOP08100 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOP08100 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOP08100 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOP08100 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOP08100 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOP08100 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOP08100 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOP08100 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOP08100 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOP08100 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOP08100 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOP08100 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOP08100 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOP08100 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOP08100 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms