Protein–RNA interactions for Protein: P05976

MYL1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL1P05976 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYL1P05976 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYL1P05976 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYL1P05976 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYL1P05976 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYL1P05976 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYL1P05976 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYL1P05976 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYL1P05976 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYL1P05976 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYL1P05976 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYL1P05976 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYL1P05976 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYL1P05976 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYL1P05976 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYL1P05976 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYL1P05976 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYL1P05976 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYL1P05976 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYL1P05976 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYL1P05976 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYL1P05976 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYL1P05976 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYL1P05976 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYL1P05976 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYL1P05976 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MYL1P05976 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MYL1P05976 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MYL1P05976 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MYL1P05976 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYL1P05976 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYL1P05976 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MYL1P05976 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYL1P05976 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYL1P05976 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYL1P05976 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYL1P05976 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYL1P05976 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYL1P05976 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYL1P05976 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYL1P05976 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYL1P05976 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MYL1P05976 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYL1P05976 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYL1P05976 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYL1P05976 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYL1P05976 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYL1P05976 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYL1P05976 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYL1P05976 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYL1P05976 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYL1P05976 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYL1P05976 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYL1P05976 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYL1P05976 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYL1P05976 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYL1P05976 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYL1P05976 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MYL1P05976 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYL1P05976 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYL1P05976 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYL1P05976 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYL1P05976 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYL1P05976 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYL1P05976 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYL1P05976 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYL1P05976 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYL1P05976 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MYL1P05976 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYL1P05976 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYL1P05976 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MYL1P05976 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYL1P05976 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYL1P05976 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYL1P05976 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYL1P05976 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
MYL1P05976 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYL1P05976 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MYL1P05976 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYL1P05976 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYL1P05976 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYL1P05976 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYL1P05976 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYL1P05976 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYL1P05976 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYL1P05976 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYL1P05976 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYL1P05976 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYL1P05976 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYL1P05976 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYL1P05976 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYL1P05976 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYL1P05976 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYL1P05976 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYL1P05976 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYL1P05976 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYL1P05976 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYL1P05976 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYL1P05976 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYL1P05976 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms