Protein–RNA interactions for Protein: P04150

NR3C1, Glucocorticoid receptor, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR3C1P04150 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR3C1P04150 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR3C1P04150 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR3C1P04150 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR3C1P04150 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR3C1P04150 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR3C1P04150 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NR3C1P04150 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR3C1P04150 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR3C1P04150 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR3C1P04150 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NR3C1P04150 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NR3C1P04150 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NR3C1P04150 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms