Protein–RNA interactions for Protein: P02766

TTR, Transthyretin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTRP02766 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTRP02766 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTRP02766 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTRP02766 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTRP02766 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTRP02766 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTRP02766 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTRP02766 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTRP02766 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTRP02766 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTRP02766 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTRP02766 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTRP02766 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTRP02766 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTRP02766 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTRP02766 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTRP02766 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTRP02766 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTRP02766 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTRP02766 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTRP02766 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTRP02766 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTRP02766 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTRP02766 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTRP02766 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTRP02766 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TTRP02766 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTRP02766 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTRP02766 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTRP02766 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTRP02766 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTRP02766 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTRP02766 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTRP02766 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTRP02766 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTRP02766 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTRP02766 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTRP02766 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTRP02766 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTRP02766 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TTRP02766 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TTRP02766 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTRP02766 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TTRP02766 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTRP02766 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTRP02766 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTRP02766 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTRP02766 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTRP02766 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTRP02766 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTRP02766 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTRP02766 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTRP02766 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTRP02766 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTRP02766 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTRP02766 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTRP02766 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTRP02766 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTRP02766 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TTRP02766 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTRP02766 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TTRP02766 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTRP02766 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTRP02766 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTRP02766 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTRP02766 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTRP02766 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTRP02766 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTRP02766 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTRP02766 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTRP02766 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTRP02766 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTRP02766 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTRP02766 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTRP02766 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTRP02766 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTRP02766 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTRP02766 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTRP02766 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTRP02766 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTRP02766 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTRP02766 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTRP02766 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTRP02766 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TTRP02766 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTRP02766 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTRP02766 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTRP02766 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTRP02766 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTRP02766 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTRP02766 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTRP02766 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTRP02766 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTRP02766 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTRP02766 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTRP02766 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TTRP02766 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TTRP02766 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTRP02766 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTRP02766 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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