Protein–RNA interactions for Protein: P01375

TNF, Tumor necrosis factor, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFP01375 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFP01375 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFP01375 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFP01375 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFP01375 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFP01375 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFP01375 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFP01375 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFP01375 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFP01375 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFP01375 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFP01375 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFP01375 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFP01375 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFP01375 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFP01375 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFP01375 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFP01375 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFP01375 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFP01375 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFP01375 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFP01375 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFP01375 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFP01375 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFP01375 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFP01375 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFP01375 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFP01375 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFP01375 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFP01375 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFP01375 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFP01375 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFP01375 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFP01375 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFP01375 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFP01375 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFP01375 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFP01375 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFP01375 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFP01375 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFP01375 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFP01375 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFP01375 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFP01375 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFP01375 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFP01375 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFP01375 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFP01375 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFP01375 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFP01375 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFP01375 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFP01375 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFP01375 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFP01375 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFP01375 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFP01375 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFP01375 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFP01375 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFP01375 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFP01375 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFP01375 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFP01375 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFP01375 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFP01375 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFP01375 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFP01375 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFP01375 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFP01375 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFP01375 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFP01375 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFP01375 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFP01375 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFP01375 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFP01375 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFP01375 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFP01375 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFP01375 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFP01375 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFP01375 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFP01375 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFP01375 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFP01375 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFP01375 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFP01375 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFP01375 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFP01375 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFP01375 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFP01375 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFP01375 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFP01375 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFP01375 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFP01375 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFP01375 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TNFP01375 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFP01375 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFP01375 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFP01375 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFP01375 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFP01375 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFP01375 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms