Protein–RNA interactions for Protein: P01011

SERPINA3, Alpha-1-antichymotrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA3P01011 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SERPINA3P01011 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SERPINA3P01011 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERPINA3P01011 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERPINA3P01011 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERPINA3P01011 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERPINA3P01011 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERPINA3P01011 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERPINA3P01011 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERPINA3P01011 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERPINA3P01011 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERPINA3P01011 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERPINA3P01011 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERPINA3P01011 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SERPINA3P01011 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERPINA3P01011 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERPINA3P01011 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERPINA3P01011 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERPINA3P01011 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERPINA3P01011 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERPINA3P01011 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERPINA3P01011 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SERPINA3P01011 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SERPINA3P01011 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SERPINA3P01011 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SERPINA3P01011 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SERPINA3P01011 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SERPINA3P01011 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPINA3P01011 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINA3P01011 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINA3P01011 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINA3P01011 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINA3P01011 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINA3P01011 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINA3P01011 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINA3P01011 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINA3P01011 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINA3P01011 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPINA3P01011 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINA3P01011 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINA3P01011 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERPINA3P01011 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms