Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX7O95931 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX7O95931 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX7O95931 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX7O95931 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX7O95931 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX7O95931 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX7O95931 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX7O95931 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX7O95931 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX7O95931 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX7O95931 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX7O95931 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX7O95931 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX7O95931 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX7O95931 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX7O95931 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX7O95931 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX7O95931 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX7O95931 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX7O95931 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX7O95931 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX7O95931 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX7O95931 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX7O95931 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX7O95931 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX7O95931 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX7O95931 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX7O95931 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX7O95931 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX7O95931 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX7O95931 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX7O95931 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX7O95931 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX7O95931 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX7O95931 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX7O95931 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX7O95931 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX7O95931 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX7O95931 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX7O95931 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX7O95931 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX7O95931 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX7O95931 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX7O95931 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX7O95931 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX7O95931 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX7O95931 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX7O95931 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX7O95931 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX7O95931 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX7O95931 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX7O95931 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX7O95931 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX7O95931 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX7O95931 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX7O95931 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX7O95931 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX7O95931 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX7O95931 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX7O95931 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX7O95931 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX7O95931 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX7O95931 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX7O95931 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX7O95931 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX7O95931 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX7O95931 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX7O95931 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX7O95931 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX7O95931 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX7O95931 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX7O95931 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX7O95931 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX7O95931 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX7O95931 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBX7O95931 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBX7O95931 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CBX7O95931 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBX7O95931 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBX7O95931 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBX7O95931 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBX7O95931 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBX7O95931 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBX7O95931 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CBX7O95931 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX7O95931 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX7O95931 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX7O95931 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX7O95931 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX7O95931 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX7O95931 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX7O95931 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX7O95931 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX7O95931 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX7O95931 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX7O95931 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX7O95931 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX7O95931 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX7O95931 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms