Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEC24BO95487 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC24BO95487 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms