Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RHOBTB3O94955 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOBTB3O94955 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms