Protein–RNA interactions for Protein: O94886

TMEM63A, CSC1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM63AO94886 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM63AO94886 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms