Protein–RNA interactions for Protein: O76011

KRT34, Keratin, type I cuticular Ha4, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT34O76011 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT34O76011 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT34O76011 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT34O76011 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT34O76011 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT34O76011 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT34O76011 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT34O76011 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT34O76011 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT34O76011 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT34O76011 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT34O76011 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT34O76011 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT34O76011 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT34O76011 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT34O76011 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT34O76011 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT34O76011 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT34O76011 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT34O76011 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT34O76011 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT34O76011 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT34O76011 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT34O76011 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT34O76011 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT34O76011 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT34O76011 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT34O76011 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT34O76011 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT34O76011 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT34O76011 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT34O76011 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT34O76011 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT34O76011 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT34O76011 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT34O76011 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT34O76011 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT34O76011 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT34O76011 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT34O76011 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT34O76011 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT34O76011 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT34O76011 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT34O76011 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT34O76011 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT34O76011 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT34O76011 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT34O76011 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT34O76011 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT34O76011 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT34O76011 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT34O76011 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT34O76011 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT34O76011 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT34O76011 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT34O76011 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT34O76011 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT34O76011 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT34O76011 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT34O76011 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT34O76011 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT34O76011 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT34O76011 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT34O76011 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT34O76011 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT34O76011 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT34O76011 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT34O76011 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT34O76011 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT34O76011 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT34O76011 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT34O76011 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT34O76011 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT34O76011 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT34O76011 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT34O76011 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT34O76011 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT34O76011 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT34O76011 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT34O76011 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT34O76011 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT34O76011 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT34O76011 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT34O76011 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT34O76011 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT34O76011 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT34O76011 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT34O76011 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT34O76011 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT34O76011 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT34O76011 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT34O76011 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT34O76011 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT34O76011 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT34O76011 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT34O76011 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT34O76011 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT34O76011 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT34O76011 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT34O76011 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms