Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BBOX1O75936 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BBOX1O75936 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BBOX1O75936 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms