Protein–RNA interactions for Protein: O75879

GATB, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATBO75879 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GATBO75879 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GATBO75879 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATBO75879 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATBO75879 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATBO75879 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATBO75879 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATBO75879 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATBO75879 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATBO75879 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATBO75879 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATBO75879 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATBO75879 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATBO75879 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATBO75879 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATBO75879 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATBO75879 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GATBO75879 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATBO75879 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATBO75879 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATBO75879 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATBO75879 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATBO75879 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATBO75879 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATBO75879 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATBO75879 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATBO75879 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATBO75879 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATBO75879 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GATBO75879 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GATBO75879 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GATBO75879 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GATBO75879 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GATBO75879 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GATBO75879 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GATBO75879 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GATBO75879 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GATBO75879 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GATBO75879 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GATBO75879 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GATBO75879 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GATBO75879 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GATBO75879 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GATBO75879 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GATBO75879 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GATBO75879 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GATBO75879 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GATBO75879 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GATBO75879 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GATBO75879 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATBO75879 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATBO75879 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATBO75879 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATBO75879 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATBO75879 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATBO75879 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GATBO75879 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATBO75879 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATBO75879 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATBO75879 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATBO75879 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATBO75879 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATBO75879 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GATBO75879 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATBO75879 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATBO75879 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GATBO75879 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GATBO75879 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GATBO75879 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GATBO75879 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GATBO75879 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GATBO75879 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GATBO75879 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GATBO75879 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GATBO75879 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GATBO75879 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GATBO75879 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GATBO75879 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GATBO75879 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GATBO75879 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GATBO75879 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GATBO75879 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GATBO75879 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GATBO75879 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GATBO75879 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GATBO75879 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GATBO75879 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GATBO75879 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GATBO75879 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GATBO75879 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GATBO75879 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GATBO75879 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GATBO75879 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GATBO75879 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GATBO75879 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GATBO75879 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GATBO75879 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GATBO75879 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GATBO75879 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GATBO75879 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152 ms