Protein–RNA interactions for Protein: O75264

SMIM24, Small integral membrane protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM24O75264 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM24O75264 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM24O75264 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM24O75264 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM24O75264 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM24O75264 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM24O75264 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM24O75264 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM24O75264 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM24O75264 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM24O75264 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1267.2 ms