Protein–RNA interactions for Protein: O75192

PEX11A, Peroxisomal membrane protein 11A, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11AO75192 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX11AO75192 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX11AO75192 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms