Protein–RNA interactions for Protein: O60841

EIF5B, Eukaryotic translation initiation factor 5B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF5BO60841 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EIF5BO60841 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EIF5BO60841 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF5BO60841 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
EIF5BO60841 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms