Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL41O60662 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL41O60662 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL41O60662 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms