Protein–RNA interactions for Protein: O60493

SNX3, Sorting nexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX3O60493 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX3O60493 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX3O60493 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX3O60493 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX3O60493 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX3O60493 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX3O60493 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX3O60493 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX3O60493 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX3O60493 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX3O60493 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX3O60493 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX3O60493 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX3O60493 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX3O60493 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX3O60493 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX3O60493 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX3O60493 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX3O60493 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX3O60493 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX3O60493 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX3O60493 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX3O60493 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX3O60493 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX3O60493 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX3O60493 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX3O60493 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX3O60493 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX3O60493 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX3O60493 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX3O60493 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX3O60493 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX3O60493 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX3O60493 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX3O60493 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX3O60493 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX3O60493 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX3O60493 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX3O60493 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX3O60493 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX3O60493 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX3O60493 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX3O60493 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX3O60493 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX3O60493 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX3O60493 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX3O60493 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX3O60493 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX3O60493 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX3O60493 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX3O60493 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX3O60493 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX3O60493 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX3O60493 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX3O60493 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX3O60493 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX3O60493 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX3O60493 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX3O60493 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX3O60493 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX3O60493 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX3O60493 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX3O60493 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX3O60493 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX3O60493 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX3O60493 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX3O60493 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX3O60493 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX3O60493 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX3O60493 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX3O60493 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX3O60493 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX3O60493 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX3O60493 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX3O60493 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX3O60493 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX3O60493 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX3O60493 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX3O60493 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX3O60493 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX3O60493 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX3O60493 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX3O60493 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX3O60493 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX3O60493 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX3O60493 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX3O60493 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX3O60493 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX3O60493 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX3O60493 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX3O60493 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX3O60493 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX3O60493 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX3O60493 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX3O60493 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX3O60493 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX3O60493 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX3O60493 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX3O60493 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX3O60493 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms