Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACTN4O43707 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACTN4O43707 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACTN4O43707 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACTN4O43707 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACTN4O43707 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACTN4O43707 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACTN4O43707 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ACTN4O43707 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACTN4O43707 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACTN4O43707 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACTN4O43707 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACTN4O43707 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACTN4O43707 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACTN4O43707 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACTN4O43707 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACTN4O43707 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACTN4O43707 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACTN4O43707 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACTN4O43707 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACTN4O43707 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ACTN4O43707 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACTN4O43707 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACTN4O43707 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACTN4O43707 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACTN4O43707 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTN4O43707 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTN4O43707 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTN4O43707 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTN4O43707 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTN4O43707 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTN4O43707 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTN4O43707 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTN4O43707 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms