Protein–RNA interactions for Protein: O43586

PSTPIP1, Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSTPIP1O43586 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSTPIP1O43586 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSTPIP1O43586 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSTPIP1O43586 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSTPIP1O43586 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSTPIP1O43586 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSTPIP1O43586 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSTPIP1O43586 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSTPIP1O43586 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSTPIP1O43586 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PSTPIP1O43586 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSTPIP1O43586 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSTPIP1O43586 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSTPIP1O43586 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSTPIP1O43586 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSTPIP1O43586 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PSTPIP1O43586 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSTPIP1O43586 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSTPIP1O43586 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSTPIP1O43586 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSTPIP1O43586 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSTPIP1O43586 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSTPIP1O43586 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSTPIP1O43586 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSTPIP1O43586 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSTPIP1O43586 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSTPIP1O43586 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSTPIP1O43586 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSTPIP1O43586 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSTPIP1O43586 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSTPIP1O43586 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSTPIP1O43586 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSTPIP1O43586 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSTPIP1O43586 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSTPIP1O43586 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSTPIP1O43586 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSTPIP1O43586 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSTPIP1O43586 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSTPIP1O43586 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSTPIP1O43586 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSTPIP1O43586 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSTPIP1O43586 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSTPIP1O43586 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSTPIP1O43586 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSTPIP1O43586 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSTPIP1O43586 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PSTPIP1O43586 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSTPIP1O43586 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSTPIP1O43586 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSTPIP1O43586 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PSTPIP1O43586 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSTPIP1O43586 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSTPIP1O43586 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSTPIP1O43586 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSTPIP1O43586 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSTPIP1O43586 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSTPIP1O43586 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms