Protein–RNA interactions for Protein: O43511

SLC26A4, Pendrin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A4O43511 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC26A4O43511 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC26A4O43511 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC26A4O43511 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms