Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF3O43395 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF3O43395 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF3O43395 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF3O43395 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF3O43395 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF3O43395 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF3O43395 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF3O43395 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF3O43395 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF3O43395 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF3O43395 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF3O43395 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF3O43395 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF3O43395 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF3O43395 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF3O43395 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF3O43395 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF3O43395 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF3O43395 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF3O43395 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF3O43395 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF3O43395 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF3O43395 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF3O43395 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF3O43395 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF3O43395 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF3O43395 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF3O43395 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF3O43395 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRPF3O43395 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms