Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SRGAP3O43295 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SRGAP3O43295 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SRGAP3O43295 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms