Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLDN3O15551 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN3O15551 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDN3O15551 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms