Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD28O15084 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms