Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CEP290O15078 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP290O15078 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP290O15078 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP290O15078 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP290O15078 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP290O15078 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP290O15078 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP290O15078 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEP290O15078 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEP290O15078 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEP290O15078 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEP290O15078 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEP290O15078 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CEP290O15078 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CEP290O15078 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CEP290O15078 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CEP290O15078 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CEP290O15078 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP290O15078 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP290O15078 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP290O15078 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP290O15078 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP290O15078 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP290O15078 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP290O15078 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP290O15078 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP290O15078 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP290O15078 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP290O15078 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP290O15078 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP290O15078 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP290O15078 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP290O15078 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP290O15078 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP290O15078 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CEP290O15078 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CEP290O15078 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CEP290O15078 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CEP290O15078 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CEP290O15078 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CEP290O15078 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CEP290O15078 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CEP290O15078 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CEP290O15078 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CEP290O15078 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CEP290O15078 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CEP290O15078 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CEP290O15078 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CEP290O15078 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CEP290O15078 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CEP290O15078 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CEP290O15078 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CEP290O15078 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CEP290O15078 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP290O15078 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP290O15078 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP290O15078 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP290O15078 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP290O15078 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP290O15078 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP290O15078 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP290O15078 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP290O15078 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP290O15078 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP290O15078 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP290O15078 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP290O15078 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP290O15078 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP290O15078 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP290O15078 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP290O15078 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP290O15078 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP290O15078 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP290O15078 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP290O15078 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP290O15078 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP290O15078 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP290O15078 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP290O15078 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP290O15078 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP290O15078 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP290O15078 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP290O15078 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP290O15078 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP290O15078 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP290O15078 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP290O15078 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP290O15078 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP290O15078 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP290O15078 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP290O15078 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP290O15078 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP290O15078 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP290O15078 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP290O15078 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP290O15078 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP290O15078 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP290O15078 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP290O15078 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
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