Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
SYNJ2O15056 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC38.47■■■■□ 3.75
SYNJ2O15056 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
SYNJ2O15056 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
SYNJ2O15056 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
SYNJ2O15056 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC38.45■■■■□ 3.75
SYNJ2O15056 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
SYNJ2O15056 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
SYNJ2O15056 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SYNJ2O15056 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
SYNJ2O15056 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SYNJ2O15056 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SYNJ2O15056 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
SYNJ2O15056 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
SYNJ2O15056 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC38.43■■■■□ 3.74
SYNJ2O15056 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
SYNJ2O15056 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
SYNJ2O15056 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
SYNJ2O15056 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SYNJ2O15056 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
SYNJ2O15056 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
SYNJ2O15056 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SYNJ2O15056 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SYNJ2O15056 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
SYNJ2O15056 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
SYNJ2O15056 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
SYNJ2O15056 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SYNJ2O15056 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SYNJ2O15056 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
SYNJ2O15056 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
SYNJ2O15056 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
SYNJ2O15056 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
SYNJ2O15056 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
SYNJ2O15056 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
SYNJ2O15056 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
SYNJ2O15056 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
SYNJ2O15056 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
SYNJ2O15056 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
SYNJ2O15056 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
SYNJ2O15056 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
SYNJ2O15056 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
SYNJ2O15056 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
SYNJ2O15056 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
SYNJ2O15056 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
SYNJ2O15056 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
SYNJ2O15056 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
SYNJ2O15056 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
SYNJ2O15056 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
SYNJ2O15056 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
SYNJ2O15056 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
SYNJ2O15056 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
SYNJ2O15056 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
SYNJ2O15056 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
SYNJ2O15056 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
SYNJ2O15056 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
SYNJ2O15056 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
SYNJ2O15056 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
SYNJ2O15056 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
SYNJ2O15056 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SYNJ2O15056 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
SYNJ2O15056 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SYNJ2O15056 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SYNJ2O15056 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
SYNJ2O15056 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC38.32■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC38.28■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
SYNJ2O15056 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms