Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAMP3O14828 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAMP3O14828 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms