Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
O00370 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
O00370 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
O00370 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
O00370 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
O00370 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
O00370 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
O00370 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
O00370 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
O00370 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
O00370 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
O00370 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
O00370 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
O00370 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
O00370 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
O00370 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
O00370 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
O00370 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
O00370 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
O00370 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
O00370 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
O00370 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
O00370 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
O00370 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
O00370 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
O00370 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
O00370 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
O00370 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
O00370 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
O00370 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
O00370 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
O00370 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
O00370 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
O00370 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
O00370 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
O00370 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
O00370 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
O00370 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
O00370 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
O00370 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
O00370 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
O00370 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
O00370 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
O00370 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
O00370 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
O00370 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
O00370 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
O00370 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
O00370 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
O00370 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
O00370 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
O00370 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
O00370 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
O00370 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
O00370 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
O00370 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
O00370 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
O00370 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
O00370 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
O00370 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
O00370 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
O00370 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
O00370 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
O00370 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
O00370 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
O00370 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
O00370 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
O00370 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
O00370 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
O00370 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
O00370 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
O00370 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
O00370 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
O00370 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
O00370 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
O00370 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
O00370 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
O00370 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
O00370 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
O00370 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
O00370 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
O00370 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
O00370 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
O00370 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
O00370 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
O00370 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
O00370 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
O00370 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
O00370 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
O00370 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
O00370 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
O00370 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
O00370 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
O00370 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
O00370 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
O00370 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
O00370 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
O00370 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
O00370 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
O00370 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.8 ms