Protein–RNA interactions for Protein: O00212

RHOD, Rho-related GTP-binding protein RhoD, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHODO00212 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHODO00212 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHODO00212 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHODO00212 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHODO00212 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHODO00212 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHODO00212 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHODO00212 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHODO00212 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHODO00212 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHODO00212 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHODO00212 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHODO00212 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHODO00212 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHODO00212 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHODO00212 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHODO00212 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHODO00212 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHODO00212 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHODO00212 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHODO00212 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHODO00212 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHODO00212 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHODO00212 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHODO00212 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHODO00212 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHODO00212 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHODO00212 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHODO00212 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHODO00212 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHODO00212 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHODO00212 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHODO00212 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHODO00212 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHODO00212 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHODO00212 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHODO00212 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHODO00212 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHODO00212 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHODO00212 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHODO00212 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHODO00212 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHODO00212 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHODO00212 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHODO00212 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHODO00212 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHODO00212 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHODO00212 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHODO00212 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHODO00212 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHODO00212 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHODO00212 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHODO00212 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHODO00212 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHODO00212 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHODO00212 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHODO00212 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHODO00212 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RHODO00212 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHODO00212 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHODO00212 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHODO00212 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHODO00212 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHODO00212 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHODO00212 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHODO00212 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHODO00212 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHODO00212 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHODO00212 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHODO00212 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHODO00212 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHODO00212 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHODO00212 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHODO00212 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHODO00212 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RHODO00212 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHODO00212 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHODO00212 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHODO00212 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHODO00212 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHODO00212 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHODO00212 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHODO00212 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHODO00212 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHODO00212 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHODO00212 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHODO00212 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHODO00212 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHODO00212 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHODO00212 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHODO00212 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHODO00212 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHODO00212 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHODO00212 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHODO00212 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHODO00212 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHODO00212 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHODO00212 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHODO00212 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHODO00212 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms