Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARVCFO00192 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARVCFO00192 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms