Protein–RNA interactions for Protein: J3QRE1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRE1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
J3QRE1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
J3QRE1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
J3QRE1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
J3QRE1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
J3QRE1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
J3QRE1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
J3QRE1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
J3QRE1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
J3QRE1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
J3QRE1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
J3QRE1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
J3QRE1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
J3QRE1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3QRE1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QRE1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QRE1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QRE1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QRE1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QRE1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QRE1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QRE1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QRE1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QRE1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QRE1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QRE1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QRE1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QRE1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QRE1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QRE1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QRE1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QRE1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QRE1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QRE1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QRE1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QRE1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QRE1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QRE1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QRE1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QRE1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QRE1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QRE1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QRE1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QRE1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QRE1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QRE1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QRE1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QRE1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QRE1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QRE1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QRE1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QRE1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3QRE1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3QRE1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3QRE1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3QRE1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3QRE1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3QRE1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
J3QRE1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3QRE1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
J3QRE1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3QRE1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3QRE1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3QRE1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3QRE1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3QRE1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3QRE1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
J3QRE1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3QRE1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3QRE1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3QRE1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QRE1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QRE1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QRE1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QRE1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QRE1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QRE1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QRE1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QRE1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QRE1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QRE1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QRE1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
J3QRE1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
J3QRE1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
J3QRE1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
J3QRE1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
J3QRE1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
J3QRE1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QRE1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QRE1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QRE1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QRE1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QRE1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QRE1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QRE1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QRE1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QRE1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QRE1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QRE1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QRE1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms