Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KT08 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KT08 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KT08 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
J3KT08 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KT08 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KT08 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KT08 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KT08 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KT08 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KT08 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KT08 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KT08 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KT08 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KT08 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KT08 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KT08 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KT08 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KT08 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KT08 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KT08 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KT08 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KT08 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KT08 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KT08 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KT08 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KT08 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KT08 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KT08 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KT08 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KT08 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KT08 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KT08 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KT08 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KT08 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KT08 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KT08 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KT08 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KT08 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KT08 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KT08 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KT08 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KT08 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KT08 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KT08 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KT08 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KT08 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KT08 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
J3KT08 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
J3KT08 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
J3KT08 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
J3KT08 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
J3KT08 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
J3KT08 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
J3KT08 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
J3KT08 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
J3KT08 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
J3KT08 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
J3KT08 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
J3KT08 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
J3KT08 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
J3KT08 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
J3KT08 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
J3KT08 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
J3KT08 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
J3KT08 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
J3KT08 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
J3KT08 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
J3KT08 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
J3KT08 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
J3KT08 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
J3KT08 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
J3KT08 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KT08 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KT08 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KT08 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KT08 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KT08 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KT08 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KT08 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KT08 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KT08 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KT08 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KT08 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
J3KT08 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
J3KT08 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
J3KT08 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
J3KT08 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
J3KT08 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
J3KT08 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
J3KT08 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
J3KT08 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
J3KT08 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
J3KT08 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
J3KT08 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
J3KT08 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
J3KT08 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
J3KT08 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
J3KT08 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
J3KT08 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms