Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HHLA1C9JL84 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HHLA1C9JL84 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms