Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00587B1AMM8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms