Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
YJEFN3A6XGL0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
YJEFN3A6XGL0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YJEFN3A6XGL0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YJEFN3A6XGL0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YJEFN3A6XGL0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YJEFN3A6XGL0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YJEFN3A6XGL0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YJEFN3A6XGL0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YJEFN3A6XGL0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YJEFN3A6XGL0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
YJEFN3A6XGL0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YJEFN3A6XGL0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YJEFN3A6XGL0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
YJEFN3A6XGL0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YJEFN3A6XGL0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YJEFN3A6XGL0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YJEFN3A6XGL0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
YJEFN3A6XGL0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
YJEFN3A6XGL0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
YJEFN3A6XGL0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YJEFN3A6XGL0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
YJEFN3A6XGL0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YJEFN3A6XGL0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YJEFN3A6XGL0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms