Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SRRM3A6NNA2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRRM3A6NNA2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms