Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC85CA6NKD9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC85CA6NKD9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC85CA6NKD9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC85CA6NKD9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC85CA6NKD9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC85CA6NKD9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms