Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF233A6NK53 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF233A6NK53 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF233A6NK53 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF233A6NK53 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF233A6NK53 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF233A6NK53 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF233A6NK53 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF233A6NK53 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF233A6NK53 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF233A6NK53 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF233A6NK53 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF233A6NK53 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF233A6NK53 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF233A6NK53 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF233A6NK53 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF233A6NK53 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms