Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW4

LRRC3C, Leucine-rich repeat-containing protein 3C, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3CA6NJW4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRC3CA6NJW4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRC3CA6NJW4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
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