Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VWA3AA6NCI4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VWA3AA6NCI4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms