Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN9

TRAPPC13, Trafficking protein particle complex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13A5PLN9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC13A5PLN9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAPPC13A5PLN9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC13A5PLN9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms