Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM89A2RUT3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM89A2RUT3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM89A2RUT3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM89A2RUT3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM89A2RUT3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM89A2RUT3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM89A2RUT3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM89A2RUT3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM89A2RUT3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM89A2RUT3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM89A2RUT3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM89A2RUT3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM89A2RUT3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM89A2RUT3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM89A2RUT3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM89A2RUT3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM89A2RUT3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM89A2RUT3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM89A2RUT3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM89A2RUT3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM89A2RUT3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM89A2RUT3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM89A2RUT3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM89A2RUT3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM89A2RUT3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms