Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms