Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X1B8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X1B8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A087X1B8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087X1B8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms