Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HECTD4Q9Y4D8 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms