Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
YBX2Q9Y2T7 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms