Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms