Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLBQ9ULI2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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