Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms